西藏自治區(qū)藏醫(yī)院前身為“拉薩門孜康”始建于1916年。1959年，西藏自治區(qū)籌委會將原“門孜康”和“藥王山利眾醫(yī)學(xué)院”兩處機(jī)構(gòu)合并建立了拉薩藏醫(yī)院,。1980年，經(jīng)自治區(qū)政府批準(zhǔn)擴(kuò)建為西藏自治區(qū)藏醫(yī)院,。通過幾次改擴(kuò)建，目前自治區(qū)藏醫(yī)院占地面積6萬5千多平方米,，建筑面積4萬平方米,，分設(shè)門診部、住院部,、藏藥廠,、藏醫(yī)藥研究院和藏藥材基地等五大區(qū)，設(shè)有12個職能部門,、12個臨床一級科室,、19個臨床二級科室、6個特色?？?、5個醫(yī)技科室，一個研究院,，一個藏藥廠?，F(xiàn)有職工700人,含國家級專家1人、自治區(qū)級專家4人,、藏醫(yī)博士生導(dǎo)師1人,，藏醫(yī)碩士生導(dǎo)師7人。

醫(yī)院擁有多臺先進(jìn)現(xiàn)代醫(yī)療設(shè)備,，開放床位326張,年門診量達(dá)到26萬人次，年住院達(dá)到4300人次?，F(xiàn)已發(fā)展成為全國規(guī)模最大的一所集醫(yī)療,、教學(xué)、科研和藏藥生產(chǎn)為一體,，專業(yè)學(xué)科較為齊全的三級甲等藏醫(yī)醫(yī)院,。

醫(yī)院以藏醫(yī)藥?？平ㄔO(shè)為重點(diǎn)，堅持以藏醫(yī)特色的辦院方向,，做到了院有?？啤⒖朴袑２?、人有專長,，先后設(shè)立了胃腸科、骨傷科,、肝病科,、心腦血管科、眼科,、外治科等藏醫(yī)?？啤Ｒ元?dú)具特色的藏醫(yī)?？圃\療技術(shù)和特效?？茖Ｋ帲Y(jié)合針灸,、推拿,、按摩以及藏醫(yī)特有的放血、火灸,、慰法,、藥浴、涂擦,、火罐,、角吸、金針等藏醫(yī)外治治療手段,，在治療腦血管疾病,、慢性萎縮性胃炎、消化性潰瘍,、糖尿病,、各類肝炎、肝硬化,、以及椎間盤突出等方面取得了顯著的療效,。

醫(yī)院制劑室是全區(qū)規(guī)模最大、藏藥生產(chǎn)量最多,、生產(chǎn)品種最多和擁有符合GMP條件現(xiàn)代化生產(chǎn)線的傳統(tǒng)藏藥龍頭企業(yè),年生產(chǎn)藏藥達(dá)80多萬噸,，生產(chǎn)藏藥350多個品種,其中已有54個國藥準(zhǔn)字號品種、15個品種列入《國家基本藥物目錄》,，10個品種列入《國家中藥保護(hù)品種》,。2004年西藏自治區(qū)藏藥廠順利通過了GMP認(rèn)證并通過了國際質(zhì)量ISO認(rèn)證,，“甘露”商標(biāo)榮獲了“中國馳名商標(biāo)”的稱號。隨著醫(yī)院整體建設(shè)不斷加強(qiáng),，專業(yè)隊伍素質(zhì)進(jìn)一步提高,，醫(yī)療安全有效保證，屢屢獲得榮譽(yù)嘉獎,。先后榮獲“全區(qū)民族團(tuán)結(jié)進(jìn)步獎”,、“全國示范藏醫(yī)院”、“全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體”,、“群眾滿意單位”,、“行風(fēng)建設(shè)先進(jìn)單位”等稱號。