西藏自治區(qū)藏醫(yī)院前身為“拉薩門孜康”始建于1916年。1959年,，西藏自治區(qū)籌委會(huì)將原“門孜康”和“藥王山利眾醫(yī)學(xué)院”兩處機(jī)構(gòu)合并建立了拉薩藏醫(yī)院。1980年,，經(jīng)自治區(qū)政府批準(zhǔn)擴(kuò)建為西藏自治區(qū)藏醫(yī)院,。通過(guò)幾次改擴(kuò)建，目前自治區(qū)藏醫(yī)院占地面積6萬(wàn)5千多平方米,，建筑面積4萬(wàn)平方米,，分設(shè)門診部、住院部,、藏藥廠,、藏醫(yī)藥研究院和藏藥材基地等五大區(qū)，設(shè)有12個(gè)職能部門,、12個(gè)臨床一級(jí)科室,、19個(gè)臨床二級(jí)科室、6個(gè)特色?？?、5個(gè)醫(yī)技科室，一個(gè)研究院,，一個(gè)藏藥廠?，F(xiàn)有職工700人,含國(guó)家級(jí)專家1人、自治區(qū)級(jí)專家4人,、藏醫(yī)博士生導(dǎo)師1人,，藏醫(yī)碩士生導(dǎo)師7人。

醫(yī)院擁有多臺(tái)先進(jìn)現(xiàn)代醫(yī)療設(shè)備,，開放床位326張,年門診量達(dá)到26萬(wàn)人次,，年住院達(dá)到4300人次。現(xiàn)已發(fā)展成為全國(guó)規(guī)模最大的一所集醫(yī)療,、教學(xué),、科研和藏藥生產(chǎn)為一體，專業(yè)學(xué)科較為齊全的三級(jí)甲等藏醫(yī)醫(yī)院。

醫(yī)院以藏醫(yī)藥?？平ㄔO(shè)為重點(diǎn),，堅(jiān)持以藏醫(yī)特色的辦院方向，做到了院有?？?、科有專病、人有專長(zhǎng),，先后設(shè)立了胃腸科,、骨傷科、肝病科,、心腦血管科,、眼科、外治科等藏醫(yī)?？?。以獨(dú)具特色的藏醫(yī)專科診療技術(shù)和特效?？茖Ｋ?，結(jié)合針灸、推拿,、按摩以及藏醫(yī)特有的放血,、火灸、慰法,、藥浴,、涂擦、火罐,、角吸,、金針等藏醫(yī)外治治療手段，在治療腦血管疾病,、慢性萎縮性胃炎,、消化性潰瘍、糖尿病,、各類肝炎,、肝硬化、以及椎間盤突出等方面取得了顯著的療效,。

醫(yī)院制劑室是全區(qū)規(guī)模最大,、藏藥生產(chǎn)量最多、生產(chǎn)品種最多和擁有符合GMP條件現(xiàn)代化生產(chǎn)線的傳統(tǒng)藏藥龍頭企業(yè),年生產(chǎn)藏藥達(dá)80多萬(wàn)噸,，生產(chǎn)藏藥350多個(gè)品種,其中已有54個(gè)國(guó)藥準(zhǔn)字號(hào)品種,、15個(gè)品種列入《國(guó)家基本藥物目錄》,，10個(gè)品種列入《國(guó)家中藥保護(hù)品種》。2004年西藏自治區(qū)藏藥廠順利通過(guò)了GMP認(rèn)證并通過(guò)了國(guó)際質(zhì)量ISO認(rèn)證,，“甘露”商標(biāo)榮獲了“中國(guó)馳名商標(biāo)”的稱號(hào),。隨著醫(yī)院整體建設(shè)不斷加強(qiáng)，專業(yè)隊(duì)伍素質(zhì)進(jìn)一步提高,，醫(yī)療安全有效保證,，屢屢獲得榮譽(yù)嘉獎(jiǎng),。先后榮獲“全區(qū)民族團(tuán)結(jié)進(jìn)步獎(jiǎng)”,、“全國(guó)示范藏醫(yī)院”、“全國(guó)衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體”,、“群眾滿意單位”,、“行風(fēng)建設(shè)先進(jìn)單位”等稱號(hào)。