藏醫(yī)學理論認為一切疾病的起因有內(nèi)外兩種因素,。內(nèi)因是隆,、赤巴、培根三大因素失調(diào),；外因是起居失常,，生活不當及環(huán)境變化。疾病種類甚多,，但歸納起來可分為熱性和寒性病兩大類,。隆病、培根病及慢性病一般屬于寒性??；赤巴病、血病及急性病一般屬于熱性病,。因而醫(yī)生診病主方時必須根據(jù)“寒者溫之,，熱者寒之“的原則，即寒性病以溫或熱性藥治療,，熱性病則以涼或寒性藥治療,，這是主要的治病原則。此外,，根據(jù)不同情況還有具體原則,，如單一病種要用主藥治療；兩種病并發(fā)，要選其主要病治療,；大病或重病以藥物治療為主,；小病輕病以調(diào)養(yǎng)為主，以藥物治療為輔,；久病不愈要考慮診斷是否正確,，用藥是否有誤等等。
       在治療方法上,，分內(nèi)治和外治,。內(nèi)治以內(nèi)服藥為主，輔佐以營養(yǎng),。在服用營養(yǎng)藥品時,，必須根據(jù)病情輕重，病的性質(zhì),，選擇相應(yīng)的滋補藥品或食物,，其目的是補虛除弱，扶正祛邪,。在外治方面,，有放血療法、按摩,、擦身,、火灸與艾灸、拔罐,、敷（熱與冷敷）罨,、藥熏、穿刺,、藥水浴等多種方法,。