藏藥學(xué)理論認(rèn)為藥物與五元有關(guān),，其性,、味,、效亦源于五元。五元（土,、水,、火、氣,、空）中土元為藥物生長之本源,；水元為藥物生長之汁液；火元為藥物生長之勢源,；氣元為藥物生長運行之動力,；空元為藥物生長之空間。五元缺一,，藥物則不能生長,。這就闡明了藥物生長與自然環(huán)境的統(tǒng)一關(guān)系。同時又指出：土水偏盛的藥物味甘,；火土偏盛的藥物味酸,；水氣偏盛的藥物味辛；土氣偏盛的藥物味澀,；火氣偏盛的藥物味咸,；氣水偏重的藥味苦。
藏醫(yī)在臨床上用藥是根據(jù)藥物的六味,、八性,、十七效辯證主方。
六味 即甘,、酸,、苦、澀,、辛,、咸,。甘味具有增強體力，補氣固本,，榮潤膚色,，開竅舒胸，生肌愈瘡,，干黃水（注：除濕之意）的功效,。苦味具有清血熱,、赤巴熱，健胃舒胸,，增生膚肌的功效,。酸味具健胃消渴，增生體溫,，生培根之效,。辛味具有增生胃熱，消積化食,，鎮(zhèn)靜催眠,，驅(qū)除腸胃寄生蟲之效。咸味具有熄風(fēng)鎮(zhèn)靜,，消煩渴,，生赤巴，干黃水,，增生血壓,，下死胎之效。澀味具有通淋止瀉,，復(fù)蘇開竅,，榮潤膚色，驅(qū)蟲之效,。
八性 即寒,、熱、輕,、重,；鈍、銳,；潤,、糙。藥性“重,、潤,、寒,、鈍”者可治隆病、赤巴??；藥性“輕、糙,、熱,、銳”者可治培根病。
十七效 即藥物具有寒,、熱,；溫、涼,；干,、稀,；潤,、糙；輕,、重,；穩(wěn)、動,；鈍,、銳；柔,、燥,；軟等十七種效能。每種藥物都具有固定的性,、味,、效。必須根據(jù)十七效的對治配伍主方,。所謂對治,，就是采用藥性與病性兩兩相對或相反的方法進行治療。寒性病用熱性藥治之,，熱性病用寒性藥治之,。同理，溫以涼,；輕以重,；柔以燥等進行對治，這就是用藥的指導(dǎo)理論和原則。