藏藥理論認(rèn)為,，藥物的生長(zhǎng)、性,、味,、效與五源即水、土,、火,、風(fēng)、空有密切關(guān)系,，而藥物的性,、味、效是臨床用藥的理論基礎(chǔ),。
       藥物的生長(zhǎng)來(lái)源于五源,。其中，土為藥物生長(zhǎng)之本源,，水為藥物生長(zhǎng)汁液,，火為藥物生長(zhǎng)熱源，氣為藥物生長(zhǎng)動(dòng)力,，空為藥物生長(zhǎng)之空間,。五源缺一，藥物則無(wú)生機(jī),。這一理論闡明了藥物生長(zhǎng)與自然環(huán)境的辯證關(guān)系,，即生態(tài)環(huán)境對(duì)植物生長(zhǎng)的特殊性。同時(shí)，它認(rèn)為藥物的性,、味,、效亦源于五源，土與水結(jié)合生出甘味,，火與土生成酸味,，水與火的成分大時(shí)則生出咸味，水與風(fēng)的成分大時(shí)則生出苦味,，火與風(fēng)的成分大時(shí)則生出辛味，土與風(fēng)的成分大時(shí)則生出澀味,。這就產(chǎn)生了藥物的六味,。
       藏藥藥物具有八種性能，即重,、潤(rùn),、涼、熱,、輕,、糙、銳,、鈍八性,。重、鈍兩者能醫(yī)治龍病和赤巴??；輕、糙,、熱,、銳能醫(yī)治培根病,；重,、潤(rùn)、涼,、鈍四者能誘發(fā)培根病,。同時(shí)也將藥物和疾病歸為寒、熱兩大類,，臨床依據(jù)對(duì)治原則,，熱性病以寒性藥物治之，寒性病以熱性藥物治之,，寒熱并存之病則寒熱藥兼用,。寒與熱，輕與重，銳與鈍,，潤(rùn)與糙是相互對(duì)立而又相互制約的矛盾統(tǒng)一體,。
       土性藥其性重、穩(wěn),、鈍,、柔、潤(rùn),、干,，能使身體堅(jiān)實(shí)，主要醫(yī)治龍??；水性藥其性稀、涼,、重,、潤(rùn)、柔,、軟,，能滋潤(rùn)身體，主要能醫(yī)治赤巴??；火性藥其性辛、銳,、干,、糙、輕,、潤(rùn),、動(dòng)，能生火熱,，主要醫(yī)治培根?。伙L(fēng)性藥物性輕,、動(dòng),、寒、糙,、燥,、干，能使身體堅(jiān)實(shí),，精氣通行,，主要醫(yī)治培根病和赤巴?。豢招运幬锝y(tǒng)帥其它四種藥物,，遍行全身,，主要治療綜合性疾病?；鹦运幒惋L(fēng)性藥是上行藥,，土性藥和水性藥是下行藥物。
       舌對(duì)藥物的感覺(jué)就是味,。藥味有甘,、酸、咸,、苦,、辛、澀六種,。酸味藥能生胃火，增長(zhǎng)消化能力,，使油脂糜爛稀釋,，還能順氣；咸味藥能使身體堅(jiān)實(shí),，有疏通作用,，能治閉塞梗阻癥，用以罨熨時(shí)則產(chǎn)生胃火,，有健胃作用,；苦味藥能開(kāi)胃、驅(qū)蟲(chóng),、止渴,、解毒，能醫(yī)治麻風(fēng),、眩暈,、瘟疫、赤巴病等疾病,，有收斂作用,，能使?jié)€、大小便干燥,，使心智敏銳,，能治乳房炎癥、聲音嘶啞等??；辛味藥物能醫(yī)治血病,、赤巴病、脂肪增多癥,，祛腐生肌,、愈合傷口，使皮膚滋潤(rùn)光澤,。
       藏醫(yī)認(rèn)為,，藥物服用后，與胃火相遇,，這時(shí)培根和赤巴被龍消化,，甘味、咸味被消化后變?yōu)楦饰?；酸味處于中間階段,，消化后仍為酸味；苦,、辛,、澀味消化后變?yōu)榭辔丁Ｏ蟮拿恳环N藥味能醫(yī)治兩種疾病,，即藏醫(yī)的“三化味”理論,。
       藏藥在臨床應(yīng)用復(fù)方甚多，單味藥很少,。藏醫(yī)組方講究君,、臣、佐,、使的配伍,，君藥是方中主藥，臣藥方中主藥之臂,，佐,、使則是根據(jù)主導(dǎo)藥的味、性,、效配伍,。另外，藏醫(yī)強(qiáng)調(diào),，用藥時(shí)必須根據(jù)病的屬性決定其藥的味,、性、效來(lái)組方,。味是主導(dǎo),，性、效是對(duì)治關(guān)系即因果關(guān)系,。病有其性,，藥亦有其性,，同性治之（寒性病用寒性藥）必遭其禍，對(duì)性治之（寒性病用熱性藥治之）必得其愈,。在藏醫(yī)理論中,，異性對(duì)治是首要原則。同理,，溫與涼,，潤(rùn)與糙，穩(wěn)與動(dòng),，輕與重等均為互為對(duì)治,。因此，配方制劑時(shí),，要把藥味起作用的藥物加在一起,，全面考慮，把功效起作用的藥味加在一起,，消化后變化作用的藥物加在一起,。